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昇思MindSpore蛋白質(zhì)結構預測模型拿下CAMEO全球預測競賽第一

2022-04-24
來源:電子創(chuàng)新網(wǎng)
關鍵詞: 昇思 MindSpore CAMEO

  近期,華為與昌平實驗室、北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)和化學與分子工程學院、深圳灣實驗室高毅勤教授課題組及鵬城實驗室陳杰團隊基于全場景AI框架昇思MindSpore開發(fā)的蛋白質(zhì)結構預測模型,在全球持續(xù)蛋白質(zhì)結構預測競賽CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn)獲得全球第一的好成績。這顯示出昇騰AI基礎軟硬件平臺在 AI+科學計算 領域的強大能力。

  

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  4月21日最新月榜競賽結果

  超越業(yè)界標桿,連續(xù)三周保持全球第一排名

  蛋白質(zhì)結構預測是人工智能走進生命科學的關鍵成果之一,對生物學研究意義重大。2020年12月,《科學》雜志評選了該年度十個重大科學突破,蛋白質(zhì)結構預測的人工智能AlphaFold就是其中非常重要的一項,因此AlphaFold成為生物研究領域的標桿成果,更是一塊重要里程碑。

  昇思MindSpore蛋白質(zhì)結構預測模型研發(fā)進展

  2021年11月,華為昇思MindSpore團隊與昌平實驗室、北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)和化學與分子工程學院、深圳灣實驗室高毅勤教授課題組聯(lián)合推出基于AlphaFold2算法的蛋白質(zhì)結構預測推理工具,并在2022年2月實現(xiàn)訓練的全流程打通,效率同比提升2-3倍。

  采用昇騰AI基礎軟硬件平臺后,在混合精度下,單步迭代時間由20秒縮短到12秒,性能提升超過60%。依托昇思MindSpore內(nèi)存復用能力,訓練序列長度由384提升至512。

  在訓練精度接近AlphaFold2的基礎上,昇思MindSpore在算法、規(guī)模和軟硬件支持等方向上持續(xù)改進,本次發(fā)布的蛋白質(zhì)結構預測模型成績持續(xù)刷新業(yè)界記錄、拿下CAMEO競賽第一,是昇思MindSpore在蛋白質(zhì)結構預測領域的又一里程碑,在填補國產(chǎn)人工智能基礎軟硬件在蛋白質(zhì)結構預測領域成績空白的同時,更加證明了其價值與優(yōu)越性。

  由瑞士生物信息研究所和巴塞爾大學聯(lián)合舉辦的 CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn)——全球持續(xù)蛋白質(zhì)結構預測競賽,被認為是蛋白質(zhì)結構預測領域最重要的比賽之一。CAMEO 競賽的規(guī)則是,每位參賽者需每周對 20 個由世界范圍內(nèi)的結構生物學家最新破解出的蛋白質(zhì)結構進行預測,其分數(shù)和名次每周都會進行在線更新。

  該競賽吸引了眾多世界范圍內(nèi)生物計算領域的前沿模型“選手”基于昇思MindSpore AI框架訓練的蛋白質(zhì)結構預測模型,一經(jīng)亮相,便領跑全球。在最近的三周CAMEO競賽中持續(xù)排名第一,意味著昇騰AI基礎軟硬件平臺在AI for Science領域的強大能力。

  未來,針對蛋白質(zhì)結構預測問題,昇思MindSpore將攜手學術科研界更多合作伙伴,在蛋白質(zhì)結構預測領域共同探索、持續(xù)突破,助力國內(nèi)相關基礎研究,尤其是生命各分支學科的進步,推動創(chuàng)新制藥行業(yè)的發(fā)展。





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