基于拓撲結構的度量學習與拓撲傳播的miRNA-疾病關聯預測算法
所屬分類:技術論文
上傳者:wwei
文檔大小:4377 K
標簽: 深度學習 miRNA-疾病關聯 度量學習
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文檔介紹:miRNA的突變和異常表達可能導致各種疾病,因此預測miRNA與疾病的潛在相關性對于臨床醫(yī)學和藥物研究的發(fā)展具有重要意義。拓撲結構是miRNA-疾病預測算法的重要組成部分,然而當前算法并未有效利用拓撲結構導致預測結果并不理想。與此同時,如何有效地融合多源數據也是當前的研究趨勢。針對上述問題,提出一種自適應融合異質節(jié)點結構信息算法(MMTP),通過利用節(jié)點的一階鄰居和元路徑誘導網絡學習結構特征,并利用度量學習和拓撲傳播自適應地融合異質節(jié)點結構信息,以提升miRNA-疾病預測精度。5折交叉驗證實驗結果表明,MMTP在HMDD v3.2數據集上的受試者操作曲線下面積(AUC)為94.81,高于其他模型。并且在基于腎癌的案例研究中,該模型所預測的前30個miRNAs全部得到證實。上述研究證明,所提的MMTP模型可有效預測miRNA-疾病相關性。
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