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基于云計算的蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)預(yù)測
所屬分類：技術(shù)論文
上傳者：wwei
文檔大小：3619 K
標(biāo)簽：云計算蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)預(yù)測
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文檔介紹：構(gòu)建基于云計算的蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)預(yù)測框架，通過數(shù)據(jù)云存儲設(shè)備獲取蛋白質(zhì)序列原始數(shù)據(jù)，采用HDFS（Hadoop Distributed File System）分布式存儲方式保存于云端。資源和隊列管理器RQM（Resource Queue Management）開啟云端虛擬機(jī)后，以之作為掃描節(jié)點(diǎn)（Sensor Node， SN），SN基于二維AB非格點(diǎn)模型建立最小蛋白質(zhì)分子能量優(yōu)化函數(shù)，采用局部搜索機(jī)制改進(jìn)的量子遺傳算法對其作優(yōu)化求解。利用云端GPU設(shè)備處理模型訓(xùn)練數(shù)據(jù)，即可實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)的自動化預(yù)測。實(shí)驗結(jié)果表明：蛋白質(zhì)序列能量勢函數(shù)計算結(jié)果更小、執(zhí)行效率更高、GDT-TS（Geothermal Development and Testing Tool Suite）評價指標(biāo)值更大。
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