基于云計算的蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)預(yù)測
所屬分類:技術(shù)論文
上傳者:wwei
文檔大?。?span>3619 K
標(biāo)簽: 云計算 蛋白質(zhì)折疊 空間結(jié)構(gòu)預(yù)測
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文檔介紹:構(gòu)建基于云計算的蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)預(yù)測框架,通過數(shù)據(jù)云存儲設(shè)備獲取蛋白質(zhì)序列原始數(shù)據(jù),采用HDFS(Hadoop Distributed File System)分布式存儲方式保存于云端。資源和隊列管理器RQM(Resource Queue Management)開啟云端虛擬機(jī)后,以之作為掃描節(jié)點(Sensor Node, SN),SN基于二維AB非格點模型建立最小蛋白質(zhì)分子能量優(yōu)化函數(shù),采用局部搜索機(jī)制改進(jìn)的量子遺傳算法對其作優(yōu)化求解。利用云端GPU設(shè)備處理模型訓(xùn)練數(shù)據(jù),即可實現(xiàn)蛋白質(zhì)折疊空間結(jié)構(gòu)的自動化預(yù)測。實驗結(jié)果表明:蛋白質(zhì)序列能量勢函數(shù)計算結(jié)果更小、執(zhí)行效率更高、GDT-TS(Geothermal Development and Testing Tool Suite)評價指標(biāo)值更大。
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